内镜诊疗室成立于2001年4月，拥有一支技术精湛的诊疗队伍。目前有主任医师3人，副主任医师5人；科室有奥林巴斯主机6台，富士能主机1台，拥有超声内镜、超细内镜、放大内镜及智能电刀，一年完成3万多例的内镜检查及内镜下治疗。

内镜清洗有周全严谨的院感监控系统，有内镜清洗工作站和全自动内镜清洗机，实现内镜清洗的机械化、标准化。

在完成内镜检查的同时，开展了EMR、ESD、EUS、ERCP、POME、消化道异物取出术、消化道狭窄的扩张及置支架术，随着内镜诊断及治疗技术的不断提高，越来越多的早期消化道肿瘤被发现并在内镜下知疗，使病人的生活质量得到提高。